Bubbleでどこのサイトから来たなどのアフェリエイト機能はつけられますか？
回答者
おっしゃってるのはアナリティクスでしょうか？
Google Analyticsプラグインがありますよ
質問者
リンクから飛んで店を予約したら紹介記事者にお金が入るみたいなことはできますか？
回答者
タイプによって違いますが、htmlエレメントで該当コードをそのまま入れたら表示されるかと思います。
ヘッダーに入れるタイプでしたら、そのページの一番親のエディタ（indexならindex、ページ画面のどこかをダブルクリック）にあります
質問者
既存を入れるってよりかは新しくシステム自体を作ることはできますか？
回答者
どういう方法をイメージされているかがちょっと掴めないのですが、プラグインを作るの領域になるかと思います。
（JavaScriptなどでゴリゴリコードを書く感じ）
具体的な方法は大野さんの要件次第でしょうか